Enfeksiyon hastalıklarının etkenleri olan bakteriler, virüsler, mantarlar, protozoonlar, helmintler ve artropodların yapısını, hastalandırıcı özelliklerini araştıran ve tespitlerine yönelik laboratuvar testlerini gerçekleştiren bölümdür. Ayrıca bu mikroorganizmalara karşı insan vücudunda oluşan bağışık yanıtın seviyesini ölçen testleri yapar, enfeksiyonların etkenleri olarak saptanan mikropların antimikrobik ilaçlara karşı duyarlılık ve direnç durumlarını tanımlayarak etkili ilaç seçiminde rehberlik sağlar. Tıbbi Mikrobiyoloji, laboratuvar ortamında mikroorganizmaların kültür ve izolasyonu, tanımlanması ve antimikrobiklere duyarlılık testlerini yapar. Tıbbi Mikrobiyoloji bölümü, bulaşıcı hastalıkların nedenlerinin saptanmasına, teşhis ve tedavisine yardımcı olur.